6月27日下午，南航民航学院第二次党员代表大会在综合楼11楼会议室隆重召开。全院123名党员代表参加了会议，学院老领导、党外人士和民主党派代表应邀参加会议。校党委常委、副校长吴庆宪，校党委组织部部长陈旭出席会议。
这次大会的主题是：认真学习领会党的十七大精神，牢固树立科学发展观，深入贯彻落实“人才强校、特色发展、开放办学、制度创新”四大战略，总结学院第一次党代会以来的各项工作，明确学院今后四年的发展目标和工作重点，选举产生民航学院第二届党委，动员和凝聚全院各级党组织和广大共产党员的智慧和力量，团结和带领全院师生员工进一步解放思想、大胆实践，以改革创新精神努力开创民航学院建设发展新局面，为把我院建设成为民航特色鲜明的高水平应用研究型学院而不懈奋斗！
会上，南京航空航天大学党委组织部部长陈旭宣读了校党委《关于同意中共南京航空航天大学民航学院委员会进行换届改选请示的批复》。民航学院党委书记冯绍红代表第一届党委作了题为《解放思想、大胆实践，以改革创新精神开创民航学院建设发展新局面》的报告。报告回顾总结了学院第一次党代会以来的各项工作，以及取得的成绩和经验，分析了学院发展所处的环境。结合学校启动民航学院“特区”建设的原则和要求，报告提出了学院今后一段时间的建设发展目标：建设具有民航竞争力的科研团队和师资队伍，建立紧扣民航需求的学科、科研和人才培养体系，使学院发展成为民航特色鲜明的高水平应用研究型学院，成为我国民航高级专业技术人才和管理人才培养基地、民航高技术应用研究基地、民航行业决策咨询基地。围绕学院建设发展目标，报告提出了学院今后的工作重点：一是紧扣民航发展脉搏，积极推动学院开放办学；二是引培并举，大力加强以师资队伍为重点的人才队伍建设；三是深化教学改革，强化育人特色；四是以学科建设为基础，构建行业需求导向的科研体系；五是深化学院管理体制和运行机制改革，提高管理水平和运行效率。“伟大的事业源于思想而立于精神”，针对“特区”建设的开创性和艰巨性特点，报告从意识和精神层面提出每一位“特区”人要牢固树立起“特区”意识，努力打造“特区”建设需要的精神。一是增强忧患意识，大力发扬只争朝夕的精神；二是增强开放意识，大力发扬改革创新的精神；三是增强大局意识，大力发扬团结协作的精神；四是增强责任意识，大力发扬真抓实干的精神。在党的建设和思想政治工作方面，报告指出学院的党建和思想政治工作必须按照党的执政能力建设和先进性建设要求，以党的创新力和执行力提升为导向，充分发挥学院党委政治核心作用，以及基层党组织和党员同志在“特区”建设中的战斗堡垒、先锋模范和排头兵作用，为学院的“特区”建设提供坚强的政治、组织和思想保证：一是进一步加强领导班子和干部队伍建设，提高领导班子和干部队伍的执政能力；二是进一步加强党的基层组织建设和党员队伍建设，努力提高各级党组织的凝聚力和战斗力；三是切实加强党的作风建设，以优良的党风促进院风建设；四是大力加强和改进思想政治工作，凝心聚力谋划“特区”建设和发展。报告最后发出号召：民航学院是我们共同的家园，民航学院的建设发展是我们共同的事业。面对难得的发展机遇，面对新时期的发展重任，面对全院2200余名师生员工的重托，每一位共产党员都应深感责任重大、使命光荣，大家要携起手来，坚定不移地在校党委的领导下，解放思想，大胆实践，以更加开阔的胸襟、更加广阔的眼界、更加进取的精神、更加务实的工作，团结和凝聚全院师生员工，克服前进道路上的一切艰难险阻，为把民航学院建设成为开放、创新、繁荣、和谐的民航特色鲜明的高水平应用研究型学院而不懈奋斗！
南京航空航天大学党委常委、副校长吴庆宪在讲话中指出，随着我国由民航大国向民航强国的战略性转变，中国民航的发展进入了新一轮发展的快车道。民航事业的快速发展在为中国民航的科教事业提供前所未有的发展机遇的同时，也提出了更高的发展要求。在校党委正式启动民航学院“特区”建设，以更加灵活、开放的模式促进学院改革和发展的关键时刻，民航学院召开第二次党员代表大会，将具有特别而重要的意义。党代会报告充分反映了学院党委、班子和全体党员对于学院发展的深谋远虑，也充分体现了全院教职工渴望学院快速发展的迫切心声，这也正是学校党委对民航学院“特区”建设的期待，标志着学院第一届党委顺利完成了“特区”建设的总体规划工作，第二届党委开始着手“特区”建设的具体实施。吴副校长最后希望民航学院能够以这次党代会为起点，抢抓发展机遇、勇挑发展重任，凝聚、团结和带领全院广大师生员工，进一步解放思想，锐意改革，开拓创新，努力推动学院各项工作迈上新的台阶。
大会还通过无记名投票方式，差额选举产生了新一届民航学院党委。
